РЕЗЮМЕ. Буйволи відіграють ключову роль у тропічних системах тваринництва, їх цінують за стійкість та високу якість молока. Буйволи породи Пандхарпурі, що вирізняються рогами у формі меча, адаптивністю до періодичного доїння та локалізованим поширенням, є цінним індійським генетичним ресурсом для вивчення адаптації та біології лактації. Метою цього дослідження було виявлення однонуклеотидних поліморфізмів (SNP) та вставлень/делецій (InDel) у всьому геномі буйволів породи Пандхарпурі та їхня функціональна анотація з метою визначення біологічного значення. Дані повторного повногеномного секвенування було оброблено та узгоджено з референтним геномом породи Мурра, після чого варіанти було класифіковано відповідно до прогнозованого функціонального впливу. Функціональне анотування було виконано за допомогою SnpEff, а для оцінки збагачення біологічних процесів було застосовано аналіз Gene Ontology (GO). Загалом було виявлено 27 009 882 SNP та 3 368 500 InDel. Більшість із них було класифіковано як модифікатори, за ними йшли категорії з низьким, помірним та високим впливом. Серед кодуючих варіантів переважали мовчазні мутації та міссенс-мутації, причому співвідношення міссенс-мутацій до мовчазних становило 0,63. Аналіз GO виявив збагачення шляхів лактації та розвитку молочної залози у всіх варіантах, тоді як варіанти з високим впливом та міссенс-варіанти були пов’язані зі шляхами імунної системи, метаболізму та реакцією на стрес. Ці результати підкреслюють генетичні та еволюційні основи продуктивності, адаптації та стійкості буйволів породи Пандхарпурі та забезпечують фундаментальний геномний ресурс для підтримки майбутніх досліджень, зокрема аналізу повногеномної асоціації та геномного відбору за економічно важливими ознаками.
Ключові слова: Пандхарпурі, повторне повногеномне секвенування, функціональна анотація, варіанти з високим впливом, міссенс-варіанти, еволюційне значення
