Цитологія і генетика 2025, том 59, № 5, 3-27
Cytology and Genetics , том , № , , doi: https://www.doi.org/

Оцінка геномної еволюції родини генів тубуліну для генотипування видів Camelina

Блюм Р.Я., Рабоконь А.М., Сахарова В.Г., Рахметов Д.Б., Пірко Я.В., Блюм Я.Б.

  1. Інститут харчової біотехнології та геноміки НАН України, Україна, 04123, Київ, вул. Байди­Вишневецького, 2А
  2. Національний ботанічний сад ім. М.М. Гришка НАН України, Україна, 01014, Київ, вул. Садово­Ботанічна, 1

Тубулін відіграє ключову роль у функціонуванні систем цитосклету, котрі регулюють такі фундаментальні процеси як поділ та ріст клітини. Коректна ідентифікація ізотипів та визначення ортології генів тубуліну у рослин є нетривіальною задачею, котра вимагає залучення комплексу біоформатичних підходів. В ході проведеного дослідження було здійснено повногеномний пошук та ідентифікацію генів тубуліну у диплоїдних представників роду Camelina, зокрема у видів C. neglecta, C. laxa, C. hispida, що дозволило ідентифікувати повні набори генів α-, β- та γ-тубулінів, а також їх псевдогенів. Філогенетичний аналіз та серія повногеномних порівнянь дозволили встановити ортологію генів тубуліну, визначити ізотипову приналежність кодованих тубулінів та відслідкувати еволюційні зміни в наборах генів тубуліну в ході дивергенції видів та виникнення алогексаплоїдного C. sativa. Генотипування зразків різних представників Camelina за допомогою TBP-, cTBP- та γTBP-маркерів дозволило ефективно диференціювати види на основі оцінки поліморфізму інтронних ділянок генів β- та γ-тубуліну. Одержані результати створюють міцне підгрунтя для подальших досліджень ізотипового та функціонального різноманіття тубулінів у Хрестоцвітих та інших груп квіткових рослин, а також спряють розробленню та впровадженню нових високоефективних систем молекулярних маркерів для ДНК-баркодингу  та маркер-опосередкованої селекції, в тому числі й таких перспективних олійних культур як C. sativa.

Ключові слова: Camelina, дикі родичі, тубулін, геномна еволюція, поліплоїдія, ДНК баркодинг, поліморфізм генів тубуліну

Цитологія і генетика
2025, том 59, № 5, 3-27

Current Issue
Cytology and Genetics
, том , № , ,
doi:

Повний текст та додаткові матеріали

У вільному доступі: PDF  

Цитована література