ISSN 0564-3783  



Головна
Контакти
Архів  
Тематика журналу
Підписка
До уваги авторів
Редколегія
Мобільна версія


In English

Export citations
UNIMARC
BibTeX
RIS





ISSR based study of fine fescue (Festuca ovina L.) highlighted the high genetic diversity of Iranian accessions

REZA MOHAMMADI, BAHMAN PANAHI, SALEH AMIRI

Реферат статті 




РЕЗЮМЕ. Festuca species здавна використовують як корм, дерн, засіб для збереження родючості грунтів та для декоративних цілей, що підкреслює важливість цього виду. Метою цього дослідження було визначення генетичної різноманітності серед 48 ізолятів тонконогової костриці з різних регіонів Ірану за допомогою ISSR-маркерів. Виявлення генетичних зв’язків між цими ізолятами передбачало застосування методу попарного внутрішньогрупового незваженого середнього (UPGMA) до набору даних щодо ISSR-маркерів. Десять ISSR-праймерів ампліфікували у 189 локусах для 48 ізолятів Festuca ovina. Всі ампліфіковані локуси були поліморфними. В ізолятах Festuca ovina з середнім індексом генетичної різноманітності в 1,522 було виявлено високий рівень генетичної різноманітності. Очікувана гетерозиготність (He) для праймерів перебувала у діапазоні від 0,153 до 0,347. Згідно з ISSR-даними, ізоляти було згруповано у дві основні групи та сім підгруп. Результати демонструють, що кожна з основних груп включала рослини з фенотипами Зелений і Срібний. Було зареєстровано невелику подібність між зразками групування ізолятів Festuca ovina на основі даних щодо ISSR-маркерів та категоризації, ґрунтованої на таких фенотипах, як Зелений і Срібний. Зрештою, результати показали велику генетичну різноманітність ізолятів F. ovina, які можна використати для альтернативних програм збереження та селекції.

Ключові слова: генетична різноманітність, ISSR, Festuca ovina L.

Цитологія і генетика 2020, том 54, № 3, C. 96-97

  • Department of Genomics, Branch for Northwest and West Region, Agricultural Biotechnology Research Institute of Iran (ABRII), Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Tabriz 5156915-598, Iran

E-mail: r.mohammadi abrii.ac.ir

REZA MOHAMMADI, BAHMAN PANAHI, SALEH AMIRI ISSR based study of fine fescue (Festuca ovina L.) highlighted the high genetic diversity of Iranian accessions, Цитологія і генетика., 2020, том 54, № 3, C. 96-97.

В "Cytology and Genetics". Якщо тільки можливо, цитуйте статтю по нашій англомовній версії:
Reza Mohammadi, Bahman Panahi & Saleh Amiri ISSR Based Study of Fine Fescue (Festuca ovina L.) Highlighted the Genetic Diversity of Iranian Accessions, Cytol Genet., 2020, vol. 54, no. 3, pp. 257–263
DOI: 10.3103/S0095452720030123


Посилання

1. Staneik, D., The genus Festuca (Poaceae: Loliinae) in Venezuela, Nord. J. Bot., 2003, vol. 23, pp. 191–205.

2. Harberd, D.J., Some observations on natural clones in Festuca ovina,New Phytol., 1962, vol. 61, no. 1, pp. 85–100.

3. Weibull, P., Ghatnekar, L., and Bengtsson, B.O., Genetic variation in commercial varieties and natural populations of sheep’s fescue, Festuca ovina L, Plant Breed., 1991, vol. 107, no. 3, pp. 203–209.

4. Wilkinson, M.J. Stace, C.A., A new taxonomic treatment of the Festuca ovina L. aggregate (Poaceae) in the British Isles, Bot. J. Linn. Soc., 2010, vol. 106, no. 4, pp. 347–397.

5. Mirhaji, M., Sanadgol, A., and Jafari, A.A., Evaluation of 16 accessions of Festuca ovina L. In the nursery of homand-abesard rangeland research station, Desalination, 2013, vol. 148, pp. 25–29.

6. Panahi, B. and Ghorbanzadeh Naghab, M., Genetic characterization of Iranian safflower (Carthamus tinctorius) using inter simple sequence repeats (ISSR) markers, Phys. Mol. Biol. Plant., 2013, vol. 19, no. 2, pp. 239–243.

7. Pirnajmedin, F., Majidi, M.M., Mirlohi, A., and Noroozi, A., Application of EST-derived microsatellite markers for analysis of genetic variation in tall fescue and its comparison with morphological markers, Biochem. Syst. Ecol., 2016, vol. 65, pp. 225–233.

8. Ghorbanzadeh Naghab, M. and Panahi, B., Molecular characterization of Iranian black cumin (Nigella sativa L.) accessions using RAPD marker, Biotechnologia, 2017, vol. 98, no. 2, pp. 97–102.

9. Ivanovych, Y.I., Udovychenko, K.M., Bublyk, M.O., and Volkov, R.A., ISSR-PCR fingerprinting of Ukrainian sweet cherry (Prunus avium L.) cultivars, Cytol. Genet., 2017, vol. 51, no. 1, pp. 40–47.

10. Campa, A. and Ferreira, J.J., Genetic diversity assessed by genotyping by sequencing (GBS) and for phenological traits in blueberry cultivars, PLoS One, 2018, vol. 13, no. 10, e0206361. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0206361

11. Kölliker, R., Boller, B. and Widmer, F., Marker assisted polycross breeding to increase diversity and yield in perennial ryegrass (Lolium perenne L.), Euphytica, 2005, vol. 146, nos. 1–2, pp. 55–65.

12. Panahi, B., Afzal, R. Ghorbanzadeh Neghab, M., Mahmoodnia, M., and Paymard, B., Relationship among AFLP, RAPD marker diversity and agromorphological traits in safflower (Carthamus tinctorius L.), Prog. Biol. Sci., 2013, vol. 3, no. 1, pp. 90–99.

13. Xiang Zhang, Q., Shen, Y.K., Shao, R.X., Fang, J., He, Y.Q., Ren, J.X., Zheng, B.S., and Chen, G.J., Genetic diversity of natural Miscanthus sinensis populations in China revealed by ISSR markers, Biochem. Syst. Ecol., 2013, vol. 48, pp. 248–256.

14. Chtourou-Ghorbel, N., Mheni, N.B., Elazreg, H., Ghariani, S., Chakroun, M., and Trifi-Farah, N., Genetic diversity in Tunisian perennial forage grasses revealed by inter-simple sequence repeats markers, Biochem. Syst. Ecol., 2016, vol. 66, pp. 154–160.

15. Tiwari, A., Kumar, B., Tiwari, B., Kadam, G.B, Saha, T.N., Genetic diversity among turf grasses by ISSR markers, Indian J. Agri. Sci., 2017, vol. 87, no. 2, pp. 251–256.

16. Azizi, H., Sheidai, M., Mozaffarian, V., and Noormohammadi, Z., Genetic and morphological diversity in Tragopogon graminifolius DC (Asteraceae) in Iran., Cytol. Genet., 2018, vol. 52, no. 1, pp. 75–79.

17. Fjellheim, S. and Rognli, O.A., Genetic diversity within and among Nordic meadow fescue (Festuca pratensis Huds.) cultivars determined on the basis of AFLP markers, Crop Sci., 2005, vol. 45, no. 5, pp. 2081–2086.

18. Elazreg, H., Ghariani, S., Chtourou-Ghorbel, N., Chakroun, M., and Trifi-Farah, N., SSRs transferability and genetic diversity of Tunisian Festuca arundinacea and Lolium perenne,Biochem. Syst. Ecol., 2011, vol. 39, no. 2, pp. 79–87.

19. Rohlf, F.J., NTSYS-pc: Numerical Taxonomy and Multivariate Analysis System Version 2.1, New York: Exeter Publishing Setauket, 2000.

20. Peakall, R. and Smouse, P.E., Genalex 6: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research, Mol. Ecol. Notes, 2006, vol. 6, no. 1, pp. 288–295.

21. Mahmoudi, B., Panahi, B., Mohammadi, S.A., Daliri, M., Babayev, M.S., Microsatellite based phylogeny and bottleneck studies of Iranian indigenous goat populations, Anim. Biotech., 2014, vol. 25, no. 3, pp. 210–222.

22. Majidi, M.M., Mirlohi, A.F., and Sayed-Tabatabaei, B.E., AFLP analyses of genetic variation in Iranian fescue accessions, Pak. J. Biol. Sci., 2006, vol. 9, pp. 1869–1876.

Copyright© ICBGE 2002-2021 Coded & Designed by Volodymyr Duplij Modified 29.11.21