Цитологія і генетика 2026, том 60, № 1, 25-47
Cytology and Genetics 2026, том 60, № 1, , doi: https://www.doi.org/

Ідентифікація та аналіз організації генів sHSP у Nicotiana attenuata та Solanum lycopersicum (Solanaceae)

Козуб Л.В., Тинкевич Ю.О., Волков Р.А., Панчук І.І.

  • Чернівецький національний університет імені Юрія Федьковича, вул. Коцюбинського, 2, 58002, Чернівці, Україна

Низькомолекулярні білки теплового шоку (sHSP) відіграють ключову роль у захисті рослин від абіотичних стресів, а також беруть участь у процесах росту й розвитку. У цій роботі за допомогою біоінформатичних підходів проведено комплексний аналіз мультигенної родини sHsp у представників родини Пасльонові (Solanaceae), яка об’єднує численні харчові, лікарські та декоративні види. У результаті скринінгу геномів двох представників цієї родини Nicotiana attenuata (койотовий тютюн), Solanum lycopersicum (томат) та модельної рослини Arabidopsis thaliana виявлено, відповідно, 52, 45 і 34 ймовірні гени sHsp та визначено їхнє хромосомне розташування. Всі гени тютюну, п’ять генів томату та один ген арабідопсису ідентифіковані вперше. Передбачувані sHSP належать до 19 класів. Вони відрізняються за розміром структурних доменів і містять сигнали локалізації в різних клітинних компартментах. Більшість класів сформувалися ще до дивергенції філогенетичних ліній Суперрозидів та Суперастеридів і збереглися впродовж подальшої еволюції дводольних, тоді як окремі класи виявилися специфічними лише для A. thaliana або представників родини Solanaceae. Для кількох sHsp характерна кластерна організація на хромосомах, що виникла внаслідок тандемних дуплікацій окремих генів протягом еволюції. У досліджених геномах ідентифіковано 15 sHsp, які кодують від двох до чотирьох альтернативних транскриптів. Аналіз промоторних ділянок показав наявність численних сайтів впізнавання транскрипційних факторів, залучених до регуляції стресових відповідей, дії світла, фітогормонів, а також контролю росту й розвитку.

Ключові слова: абіотичний стрес, біоінформатичний аналіз, будова промотора, молекулярна геноміка, мультигенні родини,α-кристаліновий домен (ACD), sHSP/HSP20, Arabidopsis, Nicotiana, Solanum

Цитологія і генетика
2026, том 60, № 1, 25-47

Current Issue
Cytology and Genetics
2026, том 60, № 1, ,
doi:

Повний текст та додаткові матеріали

У вільному доступі: PDF  

Цитована література