Дослідження виконано для ідентифікації пар праймерів до консервативних ділянок генів стійкості R до борошнистої роси та інших патогенів пшениці, ефективних для виявлення поліморфізму у спектрах ампліконів між зразками, контрастними за стійкістю до борошнистої роси. Стійкими зразками були амфідиплоїд Авротіка (геном ААВВТТ) і створені на його основі лінії пшениці (ААВВDD). Виявлення поліморфних компонентів спектрів дасть змогу використовувати відповідні пари праймерів для оцінювання перспективності сучасних сортів пшениці м’якої бути реципієнтом гена (генів) стійкості, що може бути переданий від Авротіки до генетичного пулу пшениці м’якої через статеву гібридизацію. Метод дослідження – ПЛР на геномній ДНК досліджених генотипів з застосуванням пар праймерів, розроблених з використанням послідовностей нуклеотидів у консервативних ділянках генів стійкості до борошнистої роси, а також вироджених праймерів до консервативних ділянок різних генів стійкості для довільного комбінування їх в пари за методом RGAP. Показано, що використання метода RGAP дає більше інформації про наявний поліморфізм в досліджених геномах у порівнянні з використанням праймерів до консервативних послідовностей генів Pm. Найбільшу варіабельність спостерігали з праймерами, створеними до ділянок, що кодують LRR-домени білків стійкості. Їх можна використовувати в комбінаціях з іншими праймерами за методом RGAP, для збільшення кількості ефективних ПЛР-маркерів генів стійкості.
Ключові слова: інтрогресивні лінії, Amblyopyrum muticum, пшениця м’яка, стійкість до борошнистої роси, гени стійкості, метод RGAP, ПЛР-маркери
Повний текст та додаткові матеріали
У вільному доступі: PDFЦитована література
Pritchard, J.K., Stephens, M., and Donnelly, P., In-ference of population structure using multilocus genotype data, Genetics, 2000, vol. 155, no. 2, pp. 945–959. https://doi.org/10.1093/genetics/155.2.945
Shi, Z.X., Chen, X.M., Line, R.F., Leung, H., and Wellings, C.R., Development of resistance gene analog polymorphism markers for the Yr9 gene resistance to wheat stripe rust, Genome, 2001, vol. 44, no. 4, pp. 509–516. https://doi.org/10.1139/g01-028
Shtefiuk, T.V., Mykhailyk, S.Yu., Antonyuk, M.Z., and Ternovska, T.K., Characteristics of genetic diversity in the introgression wheat lines by R genes conservative regions, Fact. Exp. Evol. Org., 2016, vol. 19, pp. 55–60. https://ekmair.ukma.edu.ua/server/api/core/bitstreams/ 26e0cbb6-3dd5-4e46-b152-a7e5d710e9d7/content.
Simeone, R., Piarulli, L., Nigro, D., Signorile, M.A., Blanco, E., Mangini, G., and Blanco, A., Mapping Powdery Mildew (Blumeria graminis f. sp. tritici) Resistance in Wild and Cultivated Tetraploid Wheats, Int. J. Mol. Sci., 2020, vol. 21, no. 21, p. 7910. https://doi.org/10.3390/ijms21217910
Slootweg, E.J., Spiridon, L.N., Roosien, J., Butterbach, P., Pomp, R., Westerhof, L., Wilbers, R., Bakker, E., Bakker, J., Petrescu, A.-J., Smant, G., and Goverse, A., Structural determinants at the interface of the ARC2 and leucine-rich repeat domains control the activation of the plant immune receptors Rx1 and Gpa2, Plant Physiol., 2013, vol. 162, no. 3, pp. 1510–1528. https://doi.org/10.1104/pp.113.218842
Vendelbo, N.M., Mahmood, K., Sarup, P., Kristensen, P.S., Orabi, J., and Jahoor, A., Discovery of a novel powdery mildew (Blumeria graminis) resistance locus in rye (Secale cereale L.), Sci. Rep., 2021, vol. 11, no. 1, p. 23057. https://doi.org/10.1038/s41598-021-02488-5
Yan, G. and Chen, X., Molecular mapping of the rps1.A recessive gene for resistance to stripe rust in BBA 2890 barley, Phytopath, 2007, vol. 97, no. 6, pp. 668–673. https://doi.org/10.1094/PHYTO-97-6-0668