Cтруктурные механизмы взаимодействия цианоакрилатов с тубулином растений

Ныпорко А.Ю., Блюм Я.Б.

Оригінальна работа 

[Free Full Text (pdf)]

Структурные механизмы, обусловливающие специфическое связывание соединений цианоакрилатной природы тубулином высших растений, исследованы на примере взаимодействия этил-(2Z)-3-амино-2-циано-4-этилгекса-2-еноата (СА1) и изопропил-(2Z)-3-амино-2-циано-4-этилгекса-2-еноата (СА2) с α-тубулином Arabidopsis thaliana. Выявлено, что цианогруппа в составе цианоакрилатов является функциональным аналогом нитрильной группы, определяющей процессы специфического взаимодействия с тубулином растений у динитроанилиновых соединений. На основании данных флуктуации пространственной структуры, динамики водородных связей и энергии взаимодействия СА1 и СА2 выявлен наиболее вероятный тип связывания этих соединений с растительным α-тубулином и охарактеризован соответствующий сайт взаимодействия. При этом 7 из 10 остатков в составе этого сайта (Глн-133, Асн-249, Вал-250, Асп-251, Вал-252, Асн-253 и Глу-254) являются облигатными компоненттами сайта связывания динитроанилинов на поверхности α-тубулина растений. Таким образом, охарактеризованный нами сайт связывания на поверхности α-тубулина способен распознавать и специфически связывать вещества, кардинально отличные по своей химической природе и не имеющие общих фармакофорных групп, при условии определенного сходства их электростатической топологии.

Ключові слова: тубулин, цианоакрилаты, специфическое взаимодействие, механизмы связывания, электростатическая топология

Цитологія і генетика 2014, том 48, № 1, C. 10-17

• Киевский национальный университет имени Тараса Шевченко
• Институт пищевой биотехнологии и геномики НАН Украины, Киев

E-mail: dfnalex gmail.com

Ныпорко А.Ю., Блюм Я.Б. Cтруктурные механизмы взаимодействия цианоакрилатов с тубулином растений, Цитологія і генетика., 2014, том 48, № 1, C. 10-17.

В "Cytology and Genetics". Якщо тільки можливо, цитуйте статтю по нашій англомовній версії:
A. Yu. Nyporko, Ya. B. Blume Structural mechanisms of interaction of cyanolcrylates with plant tubulin, Cytol Genet., 2014, vol. 48, no. 1, pp. 7-14
DOI: 10.3103/S009545271401006X