РЕЗЮМЕ. Нещодавно було виявлено, що довгі некодуючі РНК (lncRNAs) є важливими біомаркерами папілярного раку щитоподібної залози (ПРЩЗ). Метою нашого дослідження було вивчення біологічної функції та потенційної клінічної ролі lncRNA ENST00000494165 при ПРЩЗ. З січня по грудень 2019 року до дослідження в нашій лікарні було залучено 226 пацієнтів із ПРЩЗ, яким було проведено доопераційну тонкоголкову аспіраційну пункційну біопсію щитовидної залози (US-FNAB) та щодо яких було отримано підтвердження післяопераційної патології. Тканини щитовидної залози отримали із зразків FNAB і зберігали у холодильнику при –80 ºC. Було проведено аналіз кількісної ПЛР у реальному часі для виявлення відносного рівня експресії ENST00000494165. Для виявлення здатності до проліферації клітин було проведено підрахунок клітин за допомогою CCK-8 (Cell Counting Kit-8) та аналізу утворення колоній. Здатність до міграції клітин та інвазії оцінювали за допомогою трансвел-аналізу та скретч-аналізу. Також ми оцінили співвідношення між рівнем експресії ENST00000494165 та клініко-патологічними рисами ПРЩЗ. Функціональні аналізи продемонстрували, що проліферація клітин, здатність до міграції та інвазії були більш поширеними у клітинах ПРЩЗ за умови надмірної експресії ENST00000494165. Експресія ENST00000494165 у групі метастазів у лімфовузлах була значно вищою, ніж у групі метастазів не в лімфовузлах. Високий рівень експресії ENST00000494165 був суттєво пов’язаний із метас-тазами ПРЩЗ у лімфовузлах (P < 0,001). Надмірна експресія ENST00000494165 сприяла здатності до прогресії, міграції та інвазії ПРЩЗ та значно корелювала з метастазами у лімфовузлах при ПРЩЗ. ENST00000494165 може діяти в якості можливого гена промотера і потенційного біомаркера ПРЩЗ.
Ключові слова: довгі некодуючі РНК, ENST00000494165, папілярний рак щитовидної залози, проліферація та інвазія клітин, метастази в лімфатичних вузлах
Повний текст та додаткові матеріали
Цитована література
Batista, P.J. and Chang, H.Y., Long noncoding RNAs: Cellular address codes in development and disease, Cell, 2013, vol. 152, pp. 1298–1307.
Cabanillas, M.E., McFadden, D.G., and Durante, C., Thyroid cancer, Lancet, 2016, vol. 388, pp. 783–2795.
Chou, C.K., Liu, R.T., and Kang, H.Y., MicroRNA-146b: A novel biomarker and therapeutic target for human papillary thyroid cancer, Int. J. Mol. Sci., 2017, vol. 18, p. 636.
Davies, L. and Welch, H.G., Current thyroid cancer trends in the United States, JAMA Otolaryngol. Head Neck Surg., 2014, vol. 140, pp. 317–322.
Forrest, M.E. and Khalil, A.M., Review: Regulation of the cancer epigenome by long non-coding RNAs, Cancer Lett., 2017, vol. 407, pp. 106–112.
Gupta, R.A., Shah, N., Wang, K.C., et al., Long non-coding RNA HOTAIR reprograms chromatin state to promote cancer metastasis, Nature, 2010, vol. 464, pp. 1071–1076.
Gutschner, T., Hämmerle, M., and Diederichs, S., MALAT1 — a paradigm for long noncoding RNA function in cancer, J. Mol. Med., 2013, vol. 91, pp. 791–801.
Huarte, M., The emerging role of lncRNAs in cancer, Nat. Med., 2015, vol. 21, pp. 1253–1261.
Kurebayashi, J., Tanaka, K., Otsuki, T., et al., All-trans-retinoic acid modulates expression levels of thyroglobulin and cytokines in a new human poorly differentiated papillary thyroid carcinoma cell line, KTC-1, J. Clin. Endocrinol. Metab., 2000, vol. 85, pp. 2889–2896.
Li, L., Liu, B., Wapinski, O.L., et al., Targeted disruption of Hotair leads to homeotic transformation and gene derepression, Cell Rep., 2013, vol. 5, pp. 3–12.
Li, G., Zhang, Y., Mao, J., et al., LncRNA TUC338 is overexpressed in prostate carcinoma and downregulates miR-466, Gene, 2019, vol. 707, pp. 224–230.
Liao, D., Lv, G., Wang, T., et al., Prognostic value of long non-coding RNA BLACAT1 in patients with papillary thyroid carcinoma, Cancer Cell Int., 2018, vol. 18, p. 47.
Liu, Y, Li, L, Liu, Z, et al., Downregulation of MiR-431 expression associated with lymph node metastasis and promotes cell invasion in papillary thyroid carcinoma, Cancer Biomarkers, 2018, vol. 22, pp. 727–732.
Ma, S., Jia, W., and Ni, S., MiR-199a-5p inhibits the progression of papillary thyroid carcinoma by targeting SNAI1, Biochem. Biophys. Res. Commun., 2018, vol. 497, pp. 181–186.
Mercer, T.R., Dinger, M.E., and Mattick, J.S., Long non-coding RNAs: insights into functions, Nat. Rev. Genet., 2009, vol. 10, pp. 155–159.
Qin, Y., Sun, W., Zhang, H., et al., LncRNA GAS8-AS1 inhibits cell proliferation through ATG5-mediated autophagy in papillary thyroid cancer, Endocrine, 2018, vol. 59, pp. 555–564.
Rinn, J.L. and Chang, H.Y., Genome regulation by long noncoding RNAs, Annu. Rev. Biochem., 2012, vol. 81, pp. 145–166.
Siegel, R.L., Miller, K.D., and Jemal, A., Cancer Statistics, Ca-Cancer J. Clin., 2018, vol. 68, pp. 7–30
The cancer genome atlas research network. Integrated genomic characterization of papillary thyroid carcinoma, Cell, 2014, vol. 159, pp. 676–690.
Tripathi, V., Ellis, J.D., Shen, Z., et al., The nuclear-retained noncoding RNA MALAT1 regulates alternative splicing by modulating SR splicing factor phosphorylation, Mol. Cell, 2010, vol. 39, pp. 925–938.
Xia, E., Bhandari, A., Shen, Y., et al., LncRNA CCND2-AS1 promotes proliferation, migration, and invasion in papillary thyroid carcinoma, Biochem. Biophys. Res. Commun., 2018, vol. 496, pp. 628–632.
Yang, Z., Zhou, L., and Wu, L.M., Overexpression of long non-coding RNA HOTAIR predicts tumor recurrence in hepatocellular carcinoma patients following liver transplantation, Ann. Surg. Oncol., 2011, vol. 18, pp. 1243–1250.
Zhou, T., Zhong, M., Zhang, S., et al., LncRNA CASC2 expression is down-regulated in papillary thyroid cancer and promotes cell invasion by affecting EMT pathway, Cancer Biomarkers, 2018, vol. 23, pp. 185–191.