|
|||
|
![]()
In English Export citations UNIMARC BibTeX RIS Characterization and Phylogenetic Analysis of the Complete Chloroplast Genome of Xanthopappus subacaulis (Asteraceae), an Endemic Species from the Qinghai-Tibet Plateau in ChinaРеферат статті РЕЗЮМЕ. Xanthopappus subacaulis (Asteraceae) – це лікарська рослина, яка росте на високогірних луках середньоазіатського регіону, на ЦінхайТибетському плато в Китаї. У цьому дослідженні ми секвенували і проаналізували її повний геном хлоропласта (cp) за допомогою технологій секвенування нового покоління (Next Generation Sequencing), представивши перший повний геном хлоропласта для роду Xanthopappus. Наші результати показали, що геном хлоропласта X. subacaulis містить 153 297 пар основ (bp) з досить високим вмістом A + T (62,28 %) і має стандартну чотирискладову структуру, в якій великі (LSC, 84 142 bp) і малі (SSC, 18 769 bp) однокопійні області розділені двома копіями інвертованих повторів (IR, по 25 193 bp кожен). Загалом геном хлоропласта кодував 131 гени, з яких 87 – це гени, що кодують білок – 36 – гени тРНК, і вісім – гени рРНК. Більшість (85) цих генів зустрічаються в межах області LSC. Згідно з порівнянням цих результатів з опублікованим раніше геномом хлоропласта спорідненого таксону з Asteraceaeрід(рід Arctium), обидва види мали подібну кількість і тип генів, а також вміст A + T. Крім того, філогенетичний аналіз з використанням методів максимальної правдоподібності та максимальної парсимонії на основі 33 геномів хлоропласта Asteraceae дали підстави для припущення, що X. subacaulis утворює незалежну та добре обґрунтовану кладу, парафілетичну щодо всіх інших членів в межах триб Carduinae, Carlininae і Centaureinae з Asteraceae. Ключові слова: область формування пластому, Cirsium, Saussurea, Synurus, підсімейство Carduoideae, триба Carduinae, триба Centaureinae, триба Cynareae, триба Carlininae
Цитологія і генетика 2022, том 56, № 1, C. 76-78
E-mail: xusu8527972 |
|
|||
Coded & Designed by Volodymyr Duplij | Modified 28.11.23 |