Головна Контакти Архів   Тематика журналу Підписка До уваги авторів Редколегія Дестопна версія

Блюм Создание библиотеки кДНК из меристемы метелки пальчатого проса

Радчук В., Пирко Я.В., С.В. Исаенков, А.И. Емец, Я.Б. Блюм

Оригінальна работа 

Апробирован протокол получения полноразмерной кДНК на основе набора SuperScript® Full-Length cDNA Library Construction Kit II («Invitrogen» США) и роздана высококачественная библиотека кДНК из меристематической ткани метелки пальчатого проса (Eleusine coracana (L.) Gaertn). Средний титр полученной библиотеки кДНК составил 3,01·10⁵ КОЕ/мл, средняя длина вставки – около 1070 пар оснований, средняя эффективность встраивания кДНК фрагментов– 99,5 %. Проведено выборочное секвенирование клонов созданной библиотеки кДНК. Последовательности кДНК клонов идентифицированы с помощью BLAST поиска. Результаты анализа библиотеки кДНК и выборочного секвенирования свидетельствуют о хорошей функциональности и полноразмерности вставок кДНК клонов. Библиотека кДНК меристемы метелки пальчатого проса представляет собой хороший и надежный источник выделения и идентификации ключевых генов метаболизма и развития меристемы, а также получения новых генетических маркеров для проведения генетических исследований и молекулярной селекции.

РЕЗЮМЕ. Апробовано протокол отримання повнорозмірної кДНК на основі набору SuperScript® Full-Length cDNA Library Construction Kit II (»Invitrogen ,«США) та створено бібліотеку кДНК з меристематичної тканини волоті пальчастого проса (Eleusine coracana (L.) Gaertn). Середній титр отриманої бібліотеки кДНК склав 3,01 · 10⁵ КУО/мл, середня довжина вставки кДНК – біля 1070 пар основ, середня ефективність вбудовування фрагментів кДНК – 99,5 %. Проведено вибіркове секвенування клонів створеної бібліотеки кДНК. Послідовності клонів кДНК ідентифіковані за допомогою BLAST пошуку. Результати аналізу бібліотеки кДНК і вибіркового секвенування свідчать про достатній рівень функціональності та повнорозмірності клонів кДНК. Створена бібліотека кДНК меристеми волоті пальчастого проса є надійним джерелом виділення та ідентифікації нових ключових генів метаболізму ітку меристеми, а також отримання нових генетичних маркерів для проведення генетичних досліджень та молекулярної селекції.

Ключові слова: пальчатое просо, меристема, библиотека кДНК, секвенирование фрагментов кДНК

Цитологія і генетика 2014, том 48, № 5, C. 3-10

• Институт генетики растений и исследований культурных растений, Гатерслебен, Германия
• Институт пищевой биотехнологии и геномики НАН Украины, Киев

E-mail: cellbio cellbio.freenet.viaduk.net

Радчук В., Пирко Я.В., С.В. Исаенков, А.И. Емец, Я.Б. Блюм Блюм Создание библиотеки кДНК из меристемы метелки пальчатого проса, Цитологія і генетика., 2014, том 48, № 5, C. 3-10.