Головна Контакти Архів   Тематика журналу Підписка До уваги авторів Редколегія Дестопна версія

Fluorescence intensity profiles of in situ hybridization signals depict genome architecture within human interphase nuclei

Iourov I.Y., Vorsanova S.G., Yurov Y.B.

Оригінальна работа 

[Free Full Text (pdf)]

Представлен метод построения двухмерных (2D) и трехмерных (3D) профилей интенсивности сигналов флюоресцентной гибридизации in situ (FISH), основанный на количественной FISH. Настоящая методика была использована для анализа расположения и распределения сигналов в интерфазных ядрах клеток различных соматических тканей человека. Использование 2D профилей интенсивности продемонстрировало возможность определения колокализации FISH-сигналов. Более того, предложенный подход позволил идентифицировать реплицированные сигналы, дать оценку эффективности гибридизации и сравнительный анализ вариации содержания ДНК специфических участков хромосом. Построение 3D профилей показало распределение интенсивности в пределах площади сигнала. Применение этой методики позволило определить сосредоточение различных типов последовательностей ДНК: классическая сателлитная и альфоидная ДНК; геннонасыщенные (G-положительные полосы) и генноненасыщенные (G-отрицательные полосы) участки хромосом. Кроме того, методика дала возможность оценить расположение хроматина в интерфазных ядрах как культивированных, так и некультивированных клеток. В результате исследования был сделан вывод о том, что предлагаемый подход является эффективной дополнительной методикой для изучения ядерной организации, специфики вариации и расположения последовательностей ДНК в интерфазных ядрах, а также поведе- ния ядер при приготовлении хромосомных препаратов соматических клеток человека.

Цитологія і генетика 2008, том 42, № 5, C. 3-8

• National Research Center of Mental Health, Russian Academy of Medical Sciences, Moscow, Russia
• Institute of Pediatrics and Children Surgery, Roszdrav, Moscow, Russia

Iourov I.Y., Vorsanova S.G., Yurov Y.B. Fluorescence intensity profiles of in situ hybridization signals depict genome architecture within human interphase nuclei, Цитологія і генетика., 2008, том 42, № 5, C. 3-8.