ISSN 0564-3783  



Головна
Контакти
Архів  
Тематика журналу
Підписка
До уваги авторів
Редколегія
Мобільна версія


In English

Export citations
UNIMARC
BibTeX
RIS





Characterization and Phylogenetic Analysis of the Complete Chloroplast Genome of Orinus kokonoricus (Poaceae), an Endemic Species from the Qinghai-Tibet Plateau

YUPING LIU, TING LV, TAO LIU, XU SU

 




РЕЗЮМЕ. Orinus kokonoricus – це альпійська багаторічна трава (Poaceae), ендемічна для Цинхай-Тібетського нагір’я (ЦТН) в Китаї, яка має надзвичайно велику екологічну та генетичну цінність. Для того, щоб дослідити характеристики та філогенетичний аналіз повного геному хлоропласту (cp) O. kokonoricus у цьому дослідженні, ми спочатку секвенували та зібрали його cp геном за допомогою платформи Illumina HiSeq4000. Результати продемонстрували, що повний cp геном Okokonoricus має довжину 134 466 п.н. з високим вмістом AT – 61.6% і стандартну чотиристоронню структуру, включаючи одну велику унікальну послідовність (LSC, 79 932 п.н.), одну малу унікальну послідовність (SSC, 12 490 п.н.) та дві ділянки з інвертованими повторами (IRA та IRB, 21 022 п.н. в кожному). Він повністю кодує 137 генів, що містять 81 білок-кодуючий ген, 45 тРНК генів та вісім рРНК генів. Більше того, більшість цих генів присутні в унікальних послідовностях. Жоден з анотованих генів cp геному O. kokonoricus не містить інтронів. Крім того, філогенетичний аналіз на основі 40 послідовностей повного cp геному Poaceae показав, що O. kokonoricus є сестринською кладою кладі виду Eragrostis з Chloridoideae.

Ключові слова: Orinus kokonoricus; Poaceae; повний геном хлоропласту; філогенетичний аналіз; Цинхай-Тібетське нагір’я

Цитологія і генетика 2019, том 53, № 6, C. 86-87

  • Key Laboratory of Medicinal Plant and Animal Resources in the Qinghai-Tibet Plateau, School of Life Science, Qinghai Normal University, Xining 810008, China
  • Key Laboratory of Education Ministry of Environments and Resources in the Qinghai-Tibet Plateau, School of Life Science, Qinghai Normal University, Xining 810008, China

E-mail: xusu8527972 126.com

YUPING LIU, TING LV, TAO LIU, XU SU Characterization and Phylogenetic Analysis of the Complete Chloroplast Genome of Orinus kokonoricus (Poaceae), an Endemic Species from the Qinghai-Tibet Plateau, Цитологія і генетика., 2019, том 53, № 6, C. 86-87.

В "Cytology and Genetics". Якщо тільки можливо, цитуйте статтю по нашій англомовній версії:
Yuping Liu, Ting Lv, Tao Liu, Xu Su Characterization and Phylogenetic Analysis of the Complete Chloroplast Genome of Orinus kokonoricus (Poaceae), an Endemic Species from the Qinghai-Tibet Plateau, Cytol Genet., 2019, vol. 53, no. 6, pp. 510–514
DOI: 10.3103/S0095452719060045


Copyright© ICBGE 2002-2020 Coded & Designed by Volodymyr Duplij Modified 22.09.20