ISSN 0564-3783  



Главная страница
Контакты
Публикации  
Тематика журнала
Подписка
Вниманию авторов
Редколлегия
Мобильная версия


In English

Export citations
UNIMARC
BibTeX
RIS





Development of novel low­copy nuclear gene primers by transcriptomes in an endemic genus Orinus Hitchc. (Poaceae) from the Qinghai­Tibet Plateau

Yuping Liu, Xu Su, Ting Lv, Kelong Chen

 




РЕЗЮМЕ. Одинадцять маркерів низькокопійних ядерних генів було розроблено у цьому дослідженні за допомогою транскриптом роду Orinus Hitchc. (Poaceae), до якого входять три види трав, широко розповсюджених на Цинхай-Тібетському нагір’ї. Розроблені маркери були успішно ампліфіковані та секвеновані для 90 окремих рослин з дев’яти популяцій трьох видів Orinus. Послідовності ДНК для одинадцятьох локусів були в діапазоні від 606 до 1152 зв’язаних пар основ. Порівняно з чотирма перспективними маркерами ДНК-штрихкодування з наших попередніх досліджень, розроблені новітні маркери мали відносно вищу кількість змінних сайтів, ніж три спейсери пластом (7-20 проти 1-8), однак дещо нижчу у порівнянні з внутрішніми транскрибованими спейсерами (ITS). Таким чином, ці новітні пари праймерів низькокопійних ядерних генів були дуже корисними для вивчення філогеографії, філогенетичного аналізу і популяційної генетики. Окрім того, вони можуть бути корисними для реконструкції філогенезу і формування видів з широкого діапазону Orinus та навіть всього підколіна Tridentinae.

Ключевые слова: Poaceae; Orinus; транскриптом; низькокопійний ядерний ген; праймер; секвенування нового покоління

Цитология и генетика 2019, том 53, № 3, C. 78-79

  1. Key Laboratory of Medicinal Plant and Animal Resources in the Qinghai-Tibet Plateau, School of Geography and Life Science, Qinghai Normal University, Xining 810008, China
  2. Key Laboratory of Physical Geography and Environmental Process in Qinghai Province, School of Geography and Life Science, Qinghai Normal University, Xining 810008, China
  3. Key Laboratory of Education Ministry of Environments and Resources in the Qinghai-Tibet Plateau, School of Geography and Life Science, Qinghai Normal University, Xining 810008, China

E-mail: xusu8527972 126.com

Yuping Liu, Xu Su, Ting Lv, Kelong Chen Development of novel low­copy nuclear gene primers by transcriptomes in an endemic genus Orinus Hitchc. (Poaceae) from the Qinghai­Tibet Plateau, Цитология и генетика., 2019, том 53, № 3, C. 78-79.

В "Cytology and Genetics". По возможности, пожалуйста, цитируйте статью по нашей англоязычной версии:
Yuping Liu, Xu Su, Ting Lv, Kelong Chen Development of Novel Low-Copy Nuclear Gene Primers by Transcriptomes in an Endemic Genus Orinus Hitchc. (Poaceae) from the Qinghai-Tibet Plateau, Cytol Genet., 2019, vol. 53, no. 3, pp. 261–265
DOI: 10.3103/S0095452719030113


Copyright© ICBGE 2002-2020 Coded & Designed by Volodymyr Duplij Modified 03.04.20