ISSN 0564-3783  



Главная страница
Контакты
Анонсы  
Публикации  
Тематика журнала
Подписка
Вниманию авторов
Редколлегия
Мобильная версия


In English

Export citations
UNIMARC
BibTeX
RIS





Влияние артефактов пцр на эффективность генотипирования по микросателлитным локусам при использовании электрофореза в нативных полиакриламидных гелях

Кулибаба Р.А., Ляшенко Ю.В.

Оригинальная работа 




Изучен вопрос образования различных типов артефак-тов в процессе амплификации при использовании разных классов молекулярно-генетических маркеров (Indel и SSR). Показано, что в процессе амплификации гетерозиготных образцов как фрагментов целевых генов, так и микросателлитов образуется гетеродуплексная ДНК. При проведении электрофореза в нативном полиакриламидном геле продуктов амплификации гомозиготных образцов по микросателлитным локусам обнаружены специфические дополнительные фрагменты, которые не относятся к классу гетеродуплексной ДНК. Очевидно, ополнительные фрагменты относятся к особому типу гомодуплексной ДНК – нелинейным гомодуплексам. Проведенный анализ выявил, что образование нелинейной гомодуплексной ДНК происходит на 20–25-м цикле ПЦР как при амплификации ДНК опытных образцов, так и вырезанных из геля отдельных фрагментов.

РЕЗЮМЕ. Вивчено питання утворення різних типів артефактів упродовж ампліфікації при використанні різних класів молекулярно-генетичних маркерів (Indel і SSR). Встановлено, що в процесі ампліфікації гетерозиготних зразків як фрагментів цільових генів, так і мікросателітів утворюється гетеродуплексна ДНК. При проведенні електрофорезу в нативному поліакриламідному гелі продуктів ампліфікації гомозиготних зразків за мікросателітними локусами виявлено специфічні додаткові фрагменти, які не належать до класу гетеродуплексної ДНК. Зроблено припущення, що додаткові фрагменти належать до особливого типу гомодуплексної ДНК – нелінійних гомодуплексів. Проведений аналіз виявив, що утворення нелінійної гомодуплексної ДНК відбувається на 20–25-му циклі ПЛР як при ампліфікації ДНК дослідних зразків, так і вирізаних із гелю окремих фрагментів.

Ключевые слова: микросателлиты, инсерции, полимеразная цепная реакция, артефакты, гетеродуплексы, гомодуплексы
мікросателіти, інсерції, полімеразна ланцюгова реакція, артефакти, гетеродуплекси, гомодуплекси

Цитология и генетика 2016, том 50, № 3, C. 16-23

Государственная опытная станция птицеводства НААН Украины, Борки

E-mail: romankx rambler.ru

Кулибаба Р.А., Ляшенко Ю.В. Влияние артефактов пцр на эффективность генотипирования по микросателлитным локусам при использовании электрофореза в нативных полиакриламидных гелях, Цитология и генетика., 2016, том 50, № 3, C. 16-23.

В "Cytology and Genetics". По возможности, пожалуйста, цитируйте статью по нашей англоязычной версии:
R. A. Kulibaba, Y. V. Liashenko Influence of the PCR artifacts on the genotyping efficiency by the microsatellite loci using native polyacrylamide gel electrophoresis, Cytol Genet., 2016, vol. 50, no. 3, pp. 162–167
DOI: 10.3103/S0095452716030087


Copyright© ICBGE 2002-2018 Coded & Designed by Volodymyr Duplij Modified 23.05.18