Цитологія і генетика 2014, том 48, № 5, 3-10
Cytology and Genetics , том , № , , doi: https://www.doi.org/

Блюм Создание библиотеки кДНК из меристемы метелки пальчатого проса

Радчук В., Пирко Я.В., С.В. Исаенков, А.И. Емец, Я.Б. Блюм

  • Институт генетики растений и исследований культурных растений, Гатерслебен, Германия
  • Институт пищевой биотехнологии и геномики НАН Украины, Киев

Апробирован протокол получения полноразмерной кДНК на основе набора SuperScript® Full-Length cDNA Library Construction Kit II («Invitrogen» США) и роздана высококачественная библиотека кДНК из меристематической ткани метелки пальчатого проса (Eleusine coracana (L.) Gaertn). Средний титр полученной библиотеки кДНК составил 3,01·105 КОЕ/мл, средняя длина вставки – около 1070 пар оснований, средняя эффективность встраивания кДНК фрагментов– 99,5 %. Проведено выборочное секвенирование клонов созданной библиотеки кДНК. Последовательности кДНК клонов идентифицированы с помощью BLAST поиска. Результаты анализа библиотеки кДНК и выборочного секвенирования свидетельствуют о хорошей функциональности и полноразмерности вставок кДНК клонов. Библиотека кДНК меристемы метелки пальчатого проса представляет собой хороший и надежный источник выделения и идентификации ключевых генов метаболизма и развития меристемы, а также получения новых генетических маркеров для проведения генетических исследований и молекулярной селекции.

РЕЗЮМЕ. Апробовано протокол отримання повнорозмірної кДНК на основі набору SuperScript® Full-Length cDNA Library Construction Kit II (»Invitrogen ,«США) та створено бібліотеку кДНК з меристематичної тканини волоті пальчастого проса (Eleusine coracana (L.) Gaertn). Середній титр отриманої бібліотеки кДНК склав 3,01 · 105 КУО/мл, середня довжина вставки кДНК – біля 1070 пар основ, середня ефективність вбудовування фрагментів кДНК – 99,5 %. Проведено вибіркове секвенування клонів створеної бібліотеки кДНК. Послідовності клонів кДНК ідентифіковані за допомогою BLAST пошуку. Результати аналізу бібліотеки кДНК і вибіркового секвенування свідчать про достатній рівень функціональності та повнорозмірності клонів кДНК. Створена бібліотека кДНК меристеми волоті пальчастого проса є надійним джерелом виділення та ідентифікації нових ключових генів метаболізму ітку меристеми, а також отримання нових генетичних маркерів для проведення генетичних досліджень та молекулярної селекції.

Ключові слова: пальчатое просо, меристема, библиотека кДНК, секвенирование фрагментов кДНК

Цитологія і генетика
2014, том 48, № 5, 3-10

Current Issue
Cytology and Genetics
, том , № , ,
doi:

Повний текст та додаткові матеріали

Цитована література