ISSN 0564-3783  



Главная страница
Контакты
Анонсы  
Публикации  
Тематика журнала
Подписка
Вниманию авторов
Редколлегия
Мобильная версия


In English

Export citations
UNIMARC
BibTeX
RIS





A complete genetic linkage map and QTL analyses for bast fibre quality traits, yield and yield components in jute (corchorus olitorius

Topdar N., Kundu A., Sinha M.K., Sarkar D., Das M., Banerjee S., Kar C.S., Satya P., Balyan H.S., Mahapatra B.S., Gupta P.K

Оригинальная работа 




РЕЗЮМЕ. Впервые приводится полная генетическая карта микросателлитов джута (Corchorus olitorius L.; 2n = 2x = 14), полученная с помощью рекомбинантной инбредной популяции F6. Из изученных 403 микросателлитных маркеров 82 были картированы в семи группах сцепления, которые в целом занимают генетическую дистанцию в 799.9 cM со средним интервалом между маркерами 10.7 cM. По генетической дистанции самой длинной была группа сцепления 5, самой короткой группа 7, в то время как максимальное число маркеров имела группа 1, а минимальное – группа 7. Для 61 % микросателлитных локусов наблюдали нарушение расщепления, в 76 % случаев преимущество при передаче имел аллель материнского организма. Геномный непараметрический одномаркерный анализ в комбинации с моделью множественных QTL картировал 26 локусов, отвечающих за качество лубяного волокна, урожайность и признаки, связанные с урожайностью. Они неравномерно распределены в шести группах сцепления как ко-локализованные кластеры в генетических секторах, маркированных 15 микросателлитными локусами. Группа сцепления 1 была сектором, наиболее обогащенным QTL, с плотно расположенными кластерами QTL, отвечающими за выход волокна, и за признаки, связанные с урожайностью и прочностью. Как и ожидалось, в результате возникновения новых комбинаций генов от соответствующих родителей получены сочетания благоприятных локусов, за исключением почти всех локусов, определяющих тонкость волокна. Результаты являются хорошей основой для дальнейшего анализа генома джута.

РЕЗЮМЕ. Вперше наводиться повна генетична карта мікросателітів джуту (Corchorus olitorius L.; 2n = 2x = 14), отримана за допомогою рекомбінантної инбредної популяції F6. З 403 вивчених мікросателітних мар-керів 82 були картовані в семи групах зчеплення, які в цілому займають генетичну дистанцію в 799.9 cM із середнім інтервалом між маркерами 10.7 cM. За генетичної дистанції найдовшою була група зчеплення 5, найкоротшою група 7, в той час як максимальне число маркерів мала група 1, а мінімальне – група 7. Для 61 % мікросателітних локусів спостерігали порушення розщеплення, в 76 % випадків перевага при передачі мав алель материнського організму. Геномний непараметричний одномаркерний аналіз в комбінації з моделлю множинних QTL картував 26 локусів, що відповідають за якість луб’яного волокна, врожайність і ознаки, пов’язані з урожайністю. Вони нерівномірно розподілені в шести групах зчеплення як ко-локалізовані кластери в генетичних секторах, маркованих 15 мікросателітними локусами. Група зчеплення 1 була сектором, найбільш збагаченим QTL, з щільно розташованими кластерами QTL, що відповідають за вихід волокна, та за ознаки, пов’язані з врожайністю і міцністю. Як і очікувалося, в результаті виникнення нових комбінацій генів від відповідних батьків були отримані поєднання сприятливих локусів, за винятком майже всіх локусів, що визначають тонкість волокна. Результати є хорошою основою для подальшого аналізу геному джуту.

Цитология и генетика 2013, том 47, № 3, C. 3-13

  • Biotechnology Unit, Division of Crop Improvement, Central Research Institute for Jute and Allied Fibres (CRIJAF), Barrackpore, Kolkata 700120, West Bengal, India
  • Molecular Biology Laboratory, Department of Genetics and Plant Breeding, Ch. Charan Singh University, Meerut 250004, Uttar Pradesh, India

E-mail: d.sarkar excite.com

Topdar N., Kundu A., Sinha M.K., Sarkar D., Das M., Banerjee S., Kar C.S., Satya P., Balyan H.S., Mahapatra B.S., Gupta P.K A complete genetic linkage map and QTL analyses for bast fibre quality traits, yield and yield components in jute (corchorus olitorius , Цитология и генетика., 2013, том 47, № 3, C. 3-13.

В "Cytology and Genetics". По возможности, пожалуйста, цитируйте статью по нашей англоязычной версии:
N. Topdar, A. Kundu, M. K. Sinha, D. Sarkar, M. Das, S. Banerjee, C. S. Kar, P. Satya, H. S. Balyan, B. S. Mahapatra, P. K. Gupta A complete genetic linkage map and QTL analyses for bast fibre quality traits, yield and yield components in jute (Corchorus olitorius L.), Cytol Genet., 2013, vol. 47, no. 3, pp. 129-137
DOI: 10.3103/S0095452713030092


Copyright© ICBGE 2002-2017 Coded & Designed by Volodymyr Duplij Modified 24.11.17